体育学院的办学历史可以追溯到1986年原镇江船舶学院的体育师资班。2000年学校获全国认真贯彻《学校体育工作条例》的优秀普通高等学校，2007年经学校党委会研究决定在原体育部的基础上成立体育学院，并同意2008年开始在全国招收第一届社会体育专业本科生。

体育学院现设有社会体育指导与管理、休闲体育两个本科专业，除承担本学院专业教学与管理工作外，还负责全校学生的公共体育教学、体质健康监测、群体竞赛、校运动队训练、体育场馆管理等工作。现有在校本科生321人，近年来为长三角地区输送了大批体育人才，投身于体育教育、科研、管理、训练、竞赛和其他行业。

学院现有教职工55人，其中专任教师48人。专任教师中，3人具有正高级职称，23人具有副高级职称，2人为国家级运动健将。

        近年来，本着争创全国知名、省内一流体育学院的主体目标，学院在教学、科研和人才培养上取得了较好的业绩。“一操一拳一泳”的公共体育教学特色，多次受到省内外专家的肯定；“同舟共济”水上运动中心获评江苏高校来华留学生中国国情教育社会实践活动基地；承担国家社科基金、教育部人文社科基金、国家体育总局课题、江苏省教育科学规划课题等多项国家和省部级项目；荣获江苏省群众体育先进集体、江苏省体育工作先进学校、江苏省学校体育工作先进单位、江苏省高校公共体育课程考核优秀学校、江苏省学生体质健康促进工作考核先进单位等荣誉；学生在中国大学生跆拳道锦标赛、全国大学生皮划艇锦标赛等多个赛事上获得金牌。

为推进学校体育工作高质量发展，依托学校船舶特色优势，学院开设潜水、皮划艇、桨板、龙舟等“涉船涉水”类特色体育课程，得到中国日报、人民日报等国家级媒体报道，使得体育学院朝着特色鲜明、行业认可的方向持续发展（更新时间：2025年8月18日）。